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La orina no es estéril: uso de técnicas mejoradas de cultivo de orina para detec
Nuestro estudio anterior mostró que los genomas bacterianos se pueden identificar utilizando la secuenciación de rRNA 16S en muestras de orina de pacientes sintomáticos y asintomáticos cuyo cultivo es negativo de acuerdo con los protocolos estándar de cultivo de orina. En el presente estudio, utilizamos un protocolo de cultivo modificado que incluía el cultivo en placas de grandes volúmenes de orina, la incubación en condiciones atmosféricas variadas y tiempos de incubación prolongados para demostrar que muchos de los organismos identificados en la orina mediante la secuenciación del gen 16S rRNA son, de hecho, cultivables utilizando un protocolo de cultivo de orina cuantitativo expandido (EQUC). Sesenta y cinco muestras de orina (de 41 pacientes con vejiga hiperactiva y 24 controles) se examinaron utilizando las técnicas de cultivo estándar y EQUC. Cincuenta y dos de las 65 muestras de orina (80 %) desarrollaron especies bacterianas usando EQUC, mientras que la mayoría de estas (48/52 [92 %]) no reportaron crecimiento a 103 CFU/ml por el laboratorio de microbiología clínica usando el protocolo de cultivo de orina estándar.
Treinta y cinco géneros diferentes y 85 especies diferentes fueron identificados por EQUC. Los géneros más prevalentes aislados fueron Lactobacillus (15%), seguido de Corynebacterium (14,2%), Streptococcus (11,9%), Actinomyces (6,9%) y Staphylococcus (6,9%).
Otros géneros comúnmente aislados incluyen Aerococcus, Gardnerella, Bifidobacterium y Actinobaculum. Nuestro estudio actual demuestra que la orina contiene comunidades de bacterias vivas que comprenden una microbiota de orina femenina residente.
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